избыточная смертность по странам

[kobak]

Настроил скрипт, который загружает последние данные по общей смертности с https://www.mortality.org, FT (https://github.com/Financial-Times/coronavirus-excess-mortality-data), NYT (https://github.com/nytimes/covid-19-data) и The Economist (https://github.com/TheEconomist/covid-19-excess-deaths-tracker). Для каждой страны я считаю избыточную смертность по отношению к прогнозу с учетом линейнего тренда 2015--19. Начало отсчета избыточной смертности -- дата первой официальной ковидной смерти. В данных с www.mortality.org я для некоторых стан отбрасываю последние две недели, т.к. там явно неполные данные.

Для каждой страны я считаю: избыточную смертность (левый нижний угол), избыточную смертность в % от ожидаемого за весь год (правый нижний угол), избыточную смертность на 100 тысяч населения (правый верхний угол) и отношение избыточной смертности к оперативным ежедневно обновляемым данным за тот же период (левый верхний угол).

Вертикальная шкала везде начинается от нуля, но заканчивается как получится, чтобы все линии поместились. Иначе всего не разглядеть.

Страны отсортированы по избыточной смертности в % от годовой.



В России на данный момент оперштаб сообщает о 54.7 тыс. умерших, с учетом коэффициента 6.5 -- это где-то 350 тыс. избыточной смертности. Так что по избыточной смертности *на сегодня* РФ на втором месте после США, по % от годовой после Перу, Боливии, Эквадора и Мексики (близко от Мексики уже), по избыточной смертности на 100 тысяч населения приближается к Перу, по отношению реальности к оперативным данным явно вне конкуренции.

UPDATE (Dec 29): Добавил ноябрь к России.

UPDATE (Dec 30): Добавил Украину, спасибо Ивану Зайцеву. Выложил код на на https://github.com/dkobak/excess-mortality. Все данные подгружаются из облака, так что можно прямо в браузере запустить: https://colab.research.google.com/github/dkobak/excess-mortality/blob/main/all-countries.ipynb

UPDATE (Jan 4): Добавил Иран.

UPDATE (Jan 8): Добавил Грузию и Армению, спасибо athanatoi. Для США беру теперь данные с CDC, где последние недели скорректированы с учетом неполного покрытия.

Comments

[imfromjasenevo.livejournal.com]

спасибо, очень познавательно, хотя не ясно, какие выводы можно делать.
мне интересно, почему так отличаются избыточные смерти Литвы и Эстонии с Латвией.
И, к слову, а по Украине и Белоруссии данных нет?

[kobak.livejournal.com]

По Белоруссии, по-моему, открытых данных вообще нет. По Украине данные вроде бы есть (кажется, в комментариях к прошлой записи были ссылки) но там, откуда я загружаю данные, пока нет.

[akhrissanov.livejournal.com]

a worksheet у вас не выложен открыто? любопытно.

[kobak.livejournal.com]

Оффтопик, так что заморожу. Не готов обсуждать (или модерировать обсуждение) спрея экстракта красных водорослей. Но выглядит как явный булшит :)

[kobak.livejournal.com]

Выложил: https://github.com/dkobak/excess-mortality

[akhrissanov.livejournal.com]

Спасибо!

[kobak.livejournal.com]

Можно прямо в браузере запустить:

https://colab.research.google.com/github/dkobak/excess-mortality/blob/main/all-countries.ipynb

Но код, как у меня обычно бывает, написан на коленке :-(

[akhrissanov.livejournal.com]

Ну так а где ж его еще писать! Так и пишем. ну да, можно и на гугле. сейчас я его.....

[opup.livejournal.com]

Судя по картинкам, Россия к концу года в числе немногих стран, где смертность нарастает, а не снижается.

[happy-coder.livejournal.com]

Интересно, откуда отрицательная добавочная смертность взялась у НЗ с Австралией. И если это флуктуация статистики на -7%, насколько вообще можно доверять так-считаным данным. Под "так" понимаю в первую очередь ожидаемую смертность как экстраполяцию 2015/9.

[vagonsky.livejournal.com]

Скажите, а откуда взялась идея умножать на 6.5? Ведь данные об избыточной смертности уже поступают точные (как я понимаю, из Росстата)

[lev-usyskin.livejournal.com]

спасибо

[strannik1.livejournal.com]

Какой то в графиках бред выходит.
Сравните Чехию и Словакию. Разные планеты?

[kobak.livejournal.com]

В Словакии тоже вверх идет, но чуть позже и не так сильно:

https://ourworldindata.org/coronavirus-data-explorer?zoomToSelection=true&country=SVK~CZE®ion=World&deathsMetric=true&interval=smoothed&perCapita=true&smoothing=7&pickerMetric=location&pickerSort=asc

Данные по избыточной смертности отстают.

[kobak.livejournal.com]

Росстатовские данные есть пока только за октябрь. За ноябрь и декабрь пока нет. 6.5 -- это отношение избыточной смертности за апрель--октябрь к данным оперативного штаба за апрель--октябрь. По пропорции можно прикинуть избыточную смертность на сегодня.

[kobak.livejournal.com]

Это не флуктуация, а эффект карантина и социального дистанцирования. Там очень быстро ввели ограничения и остановили ковид, так что ковидных смертей почти нет вообще.

[kobak.livejournal.com]

"Психопандемию", "хунту" и "концлагерь", пожалуйста, обсуждайте где-нибудь в другом месте. Ваш комментарий скриню.

[denalt.livejournal.com]

А что Индии нет?

[kobak.livejournal.com]

Индия не публикует цифры по общей смертности.

[vagonsky.livejournal.com]

Понятно, спасибо

[happy-coder.livejournal.com]

а, то есть мало того, что нет смертей ковидных, повышенный уровень карантина, не конвертируясь в стресс, конвертируется в уменьшение числа обычных контактов - и, как следствие, уменьшение смертей от "обычных" болезней? условно всяких там ОРВИ - так?

а что такое масштабный коэффициент 6,5 (ну, и аналогичный на других графиках), почему на него надо домножать смерти?

[kobak.livejournal.com]

Думаю, что так, да. Но вообще было бы интересно посмотреть на разбивку по причинам смертности в Австралии и НЗ, чтобы понять, за счет каких именно факторов смертность уменьшилась. Вполне возможно, что это в основном грипп. Там как раз обычный зимний "горбик" уменьшился.

Про 6.5 тут ответил: https://kobak.livejournal.com/117436.html?thread=2402492#t2402492

[happy-coder.livejournal.com]

хм
то есть полная избыточная смертность для РФ плюс 11%
а для Перу полная избыточная смертность плюс 68%
верно понимаю ваши цифры?

а откуда тогда вот этот вывод?
>> так что все числа для России (которые на графике получены из данных Росстата на конец октября) можно умножать почти на два

если у вас полная смертность уже указана - зачем её умножать?

[happy-coder.livejournal.com]

и да, спасибо за расчёт, очень интересный! : )

[kobak.livejournal.com]

Да. 11% и 68% -- это в процентах от обычной годовой смертности. В Перу очень молодое население, там обычная годовая смертность на душу населения гораздо меньше, чем в Европе.

Про умножение на 6.5 я же написал: https://kobak.livejournal.com/117436.html?thread=2402492#t2402492. Данные на картинке на конец октября. Если хотите грубо прикинуть избыточную смертность *на сегодня*, то можно умножить на два.