смирнов про ящериц
Jan. 30th, 2017 03:47 pmИнтересное интервью Смирнова Гельфанду: http://trv-science.ru/2017/01/17/stanislav-smirnov-mathwalks/. Среди прочего, Смирнов говорит: "Последняя статья, которую я написал с коллегами, как раз по биологии. Мы изучаем раскраску конкретного семейства ящериц и показываем, что уравнения реакции-диффузии Тьюринга, связывающие концентрации хроматофоров, при переменных коэффициентах..." (тут Гельфанд его перебивает). Попытался найти эту статью и не могу; в архиве нет, в google scholar нет, на женевском сайте Смирнова нет, на сайте лаборатории Чебышева тоже нет. Может быть, статья еще не написана? Судя по разговору, непохоже: Гельфанд там хмыкает, мол, это простая математика и простая биология, а Смирнов ему на это -- ты не торопись, лучше почитай. Никто не знает, о чем речь?
Еще Смирнов рассказывает про (в ML хорошо известные) recommender systems для нетфликсовского конкурса на базе SVD with missing data и говорит, что это "похоже на биологические вещи". Это спорно, и Гельфанд сразу начинает спорить; но может быть, и правда похоже. Я вот как раз с нового года настраиваю что-то подобное для single cell RNA sequencing: технология фантастическая, но глубина секвенирования (пока?) не очень и существенный процент генов не детектируется, т.е. их уровень экспрессии измерен как нулевой, хотя на самом деле это missing value.
Еще Смирнов рассказывает про (в ML хорошо известные) recommender systems для нетфликсовского конкурса на базе SVD with missing data и говорит, что это "похоже на биологические вещи". Это спорно, и Гельфанд сразу начинает спорить; но может быть, и правда похоже. Я вот как раз с нового года настраиваю что-то подобное для single cell RNA sequencing: технология фантастическая, но глубина секвенирования (пока?) не очень и существенный процент генов не детектируется, т.е. их уровень экспрессии измерен как нулевой, хотя на самом деле это missing value.