смертность за август

[kobak]

Собирался сделать помесячную анимацию, а также переделать модель на основе помесячных региональных данных с 2006 года (оказывается, они доступны), но не нашел на это времени. Так что пока просто вешаю обновленные картинки с августовскими данными:





Общая смертность по месяцам, с апреля по август: 4 тыс., 17 тыс., 19 тыс., 37 тыс., 10 тыс.

Об этом как-то мало говорят, но официально в Башкортостане и Татарстане от ковид19 умерло по 40--50 человек. Т.е. там недоучет на *два порядка*. По всей стране где-то раз в пять всего.

PS. Заметил, что FT наконец обновили свои графики избыточной смертности в конце сентября: https://www.ft.com/content/a2901ce8-5eb7-4633-b89c-cbdf5b386938. Для сравнения официальные цифры есть тут: https://ourworldindata.org/covid-deaths. В Перу и Эквадоре превышение избыточной смертности над официальной примерно в три раза. В Англии и Италии примерно в полтора раза.

Comments

[mopexod.livejournal.com]

Дмитрий, скажите, а почему вы считаете избыточную смертность как превышение от среднего, а не, скажем, от одного стандартного отклонения?
Я понимаю, что тут никакого объективного порога нету. Но даже без всякого ковида, считая от среднего, мы получим 'повышенную смертность' примерно каждый второй месяц на величину порядка 1 STD.
По Москве, видимо, как считать разницы особой нет, там больше нескольких STD.
А по Израилю большая часть недель этого года в пределах одного STD; есть всего несколько недель выше одного, и три недели выше двух. Если суммировать только недели, которые выше среднего, то у нас тут мор. А если просуммировать просто все недели, то самый средний год.

[kobak.livejournal.com]

Это верно, но я же все месяцы суммирую (начиная с апреля), а не только те, где превышение над средним. Какие с этим проблемы?

[mopexod.livejournal.com]

У меня смутное ощущение, что стоит отнять ~стандартное отклонение за весь период (если, скажем, считали за год, то годовое, а не ежемесячное STD).
Потому как, опять же, примерно каждый второй год выше среднего.

Но я совсем не статистик, мне просто попалась наша израильская понедельная гос-статистика смертей, и эксель.

И ещё: вы же в качестве baseline берёте тренд по прошлым годам. Линейный или квадратичный?

У нас если взять статистику за все 20 лет, насколько она есть в едином формате, квадратичный тренд довольно очевиден. Линейный, может, лет на 10 выглядит нормально. Ну, это понятно, учитывая рост населения 80 лет назад...

[kobak.livejournal.com]

Ну, тут нет правильного и неправильного подхода: можно считать и так, и сяк. Важно только четко обозначать, что именно посчитано. Лично мне отклонение от среднего кажется более понятной и интуитивной величиной. Каждый второй город выше среднего, да. Если считать по-вашему, то почти каждый год "избыточная смертность" будет отрицательной, это мне кажется неинтуитивно.

Я бы сказал, что Ваш подход дает оценку снизу. А мой подсчет unbiased, но с большой погрешностью.

Что касается тренда, то я ограничился линейным, но сейчас понял, что считал его не совсем правильно. Переделываю сейчас все на основе помесячных данных с 2006 года (мне подсказали, где из раздобыть), и честно говоря, пока не знаю, как лучше. Вот как выглядит график по стране:



Показаны линейный фит, квадратичный, и линейный с 2011. Разница довольно существенная, почти 5000 в месяц (!). На глаз мне хочется поставить точку где-то между красной и фиолетовой.

[mopexod.livejournal.com]

Да, про превышение над средним - это очевидно понятнее и вызывает меньше вопросов.

У меня тренд по Израилю такой:



С 2010 года он отлично проапроксимируется прямой (и 2020 будет почти точно совпадать с квадратичным приближением), но, учитывая предисторию, это будет совсем неправильно.

[kobak.livejournal.com]

Я посмотрел, как эти кривые ведут себя в разных регионах в РФ, и пока остановился на неоптимальном, но простом варианта: линейный фит на участке 2015--2019.

[oude-rus.livejournal.com]

квадратичный явно промахивается.

[in-kant.livejournal.com]

Все правильно, надо считать превышение от среднего (точнее, экстраполированного из прошлых лет) - а стандартное отклонение переходит в доверительный интервал избыточной смертности.

[bbb.livejournal.com]

Я правильно понимаю, что красные цифры (например, 13250 по Москве) - это то, что согласно вашим исчислениям следует считать избыточной смертностью за август в данном регионе? Что в переводе на дни означает примерно 400 с лишком избыточных смертей в день в течение августа?

[kobak.livejournal.com]

Нет, нет, это сумма с апреля по август включительно! Соответствует площади красной области на графике.

[oude-rus.livejournal.com]

но при этом народ упрямо пишет, что вся эта радость совпадает с обычными показателями эпидемий ОРВИ.

О бессилии науки перед тайною COVID

[livejournal.livejournal.com]

User nikolamsu referenced to your post from О бессилии науки перед тайною COVID (https://nikolamsu.livejournal.com/169440.html) saying: [...] https://kobak.livejournal.com/114772.html [...]

[nikolamsu.livejournal.com]

"Об этом как-то мало говорят, но официально в Башкортостане и Татарстане от ковид19 умерло по 40--50 человек. Т.е. там недоучет на *два порядка*. По всей стране где-то раз в пять всего".
ПМСМ, первая гипотеза при таких данных, которую стоит проверить, состоит в том, что смертность выросла из-за того, что у многих нековидных больных откладывают прием/процедуры/операции, многие нековидные больные сами не обращаются своевременно за медпомощью.
Можно бросить в меня ссылкой на то место, где вы эту гипотезу разобрали (или кто-то другой разобрал) и нашли несостоятельной (раз переходите к следующей, требующей нетривиальных предположений)?

[kobak.livejournal.com]

Такой ссылки у меня нет, и такой разбор мне не известен. Честно говоря, мое априорное мнение о том, какую гипотезу тут следует считать "первой", а какую -- "следующей, требующей нетривиальных предположений", диаметрально противоположно Вашему.

Впрочем, это не так важно, т.к., по-моему, данные не особо согласуются с Вашей первой гипотезой. Возьмите Башкирию и Татарстан: карантин был когда, в мае? (Если он вообще там был?) Избыточная смертность была при этом на нуле. Как видно на моем графике, смертность внезапно рванула наверх в июле; как Ваша гипотеза это объясняет? С чего бы там вдруг стали откладывать прием нековидных больных именно в июле?

Кроме того, "недоучет" радикально различается между регионами. В Москве недоучет составляет 2.7 (т.е. избыточная смертность в 2.7 раз больше, чем официально умерло от ковида с подтвержденным диагнозом). В Питере 2.1. В Московской области 3.5. А в Башкортостане 130. СТО ТРИДЦАТЬ, КАРЛ. Как Ваша первая гипотеза может объяснить такой гигантский разброс?

[nikolamsu.livejournal.com]

Спасибо за ответ.

" мое априорное мнение о том, какую гипотезу тут следует считать "первой", а какую -- "следующей, требующей нетривиальных предположений", диаметрально противоположно Вашему"
Вижу. Но не понимаю.
Отложенные операции, мед. процедуры, отложенные обращения к врачам, резкое изменение образа жизни (в том числе у пожилых), тяжелый стресс -- все это не могло не дать очень существенный вклад в смертность. Тут, как мне кажется, просто не о чем спорить.
Каков этот вклад в разных регионах с разными "карантинами"? Это вопрос на миллиарды, триллионы долларов и на неизвестное количество человеческих жизней в масштабах планеты (уж простите мне этот пафос). Может этот вклад в смертность быть и больше числа жертв COVID? А никто не знает.
По Оккаму первая гипотеза (Г1), которую стоит проверить, состоит в том, что "избыточная смертность минус зарегистрированные жертвы COVID" -- это и есть жертвы "отложки/изменения/стресса".
Вполне допускаю, что первая гипотеза неверна, такое часто бывало в моей жизни.
Но то, что даже вы(!), плотно занимаясь этой темой, не проводили её анализ и даже о таком не слышали -- меня удивляет и пугает.
Также, методологической строгости ради, не могу не отметить, что гипотеза 2 "чиновники заметно фальсифицируют, вольно или невольно, число умерших от COVID" содержит два подварианта:
вариант 2а: занижают число умерших от COVID (например, чтобы показать, что местный губернатор/мед. начальник такой молодец, что и ковидлу злую отпугивает от людишек... хотя... в их KPI точно входит смертность/смертность от распространенных причин, так что смысл такого варианта ясен не до конца);
вариант 2б: завышают число умерших от COVID (например, чтобы обосновать свои "карантинные мероприятия", введенные из административные/бизнес-коррупционные соображений).
Вариант 2б обычно игнорируется.
*******

"данные не особо согласуются с Вашей первой гипотезой. Возьмите Башкирию и Татарстан"
Я прекрасно понимаю, что гипотезу 1 нельзя считать подтвержденной.
Но нельзя считать подтвержденными и гипотезы 2а и 2б.
Также отмечу, что
- ваше замечание по Башкирии и Татарстану, для начала, нельзя с ходу обобщить на все регионы;
- рывок смертности вверх _после_ прохождения первого пика эпидемии и смягчения "карантина" как раз сложно объяснить в рамках гипотезы 2а (ну объективно стало меньше "ковидников" в середине лета), но не в рамках гипотезы 1 (пациенты типа "да, болит сердце/живот что-то... ну да ничего, отлежусь/приму пилюльку" как раз с задержкой и превращаются в "лишние трупы").

[kobak.livejournal.com]

Но то, что даже вы(!), плотно занимаясь этой темой, не проводили её анализ и даже о таком не слышали -- меня удивляет и пугает.

Уточнение по первой части: я не говорил и не имел в виду, что я не слышал об этой гипотезе. Конечно же, слышал много раз, в т.ч. и у меня в комментариях об этом писали.

Вот, например, длинное обсуждение: https://kobak.livejournal.com/113878.html?thread=2222294#t2222294

Я согласен с этим комментарием in_kant: https://kobak.livejournal.com/113878.html?thread=2223318#t2223318

В целом вы совершенно правы. Избыточная смертность - это A + B - C, где A - это жертвы вируса, B - жертвы карантина, а C - те, кто не умер благодаря карантину (в широком смысле слова).

Просто есть основания считать, что если пандемия в регионе хоть сколько-то разгулялась, то A >> B-C

Косвенно об этом свидетельствует и тот факт, что в странах, которые вводили достаточно жесткий карантин, но при этом слабо пострадали от ковида, избыточная смертность очень низкая.

Также процитирую мой комментарий там: https://kobak.livejournal.com/113878.html?thread=2224342#t2224342

Никаких избыточных смертей просто от введения карантина в отсутствии вспышки эпидемии нет, этому есть масса примеров. В странах вроде Италии жесткий карантин был по всей стране, а избыточная смертность только на севере.

https://twitter.com/jburnmurdoch/status/1282713336447143936

**********************************************************

Но наше обсуждение предлагаю сосредоточить на второй части, т.е. на наблюдаемых данных в РФ.

Я прекрасно понимаю, что гипотезу 1 нельзя считать подтвержденной.
Но нельзя считать подтвержденными и гипотезы 2а и 2б.
Также отмечу, что
- ваше замечание по Башкирии и Татарстану, для начала, нельзя с ходу обобщить на все регионы;
- рывок смертности вверх _после_ прохождения первого пика эпидемии и смягчения "карантина" как раз сложно объяснить в рамках гипотезы 2а (ну объективно стало меньше "ковидников" в середине лета), но не в рамках гипотезы 1 (пациенты типа "да, болит сердце/живот что-то... ну да ничего, отлежусь/приму пилюльку" как раз с задержкой и превращаются в "лишние трупы").

Если честно, я просто не понял, что Вы имеете в виду. Ясно же, что эпидемия в Татарстан/Башкирию пришла позже, чем в Москву. Никакого прохождения первого пика к июлю там не было, там в июле только первый пик и начался.

Еще раз -- объяснять я Вам предлагаю *разницу* между регионами. Если Ваша теория состоит в том, что избыточные нековидные смерти появляются на несколько месяцев позже пика эпидемии (И ИХ В СТО РАЗ БОЛЬШЕ, ЧЕМ КОВИДНЫХ СМЕРТЕЙ), то почему мы не видим это в Москве, а только в Татарстане?

Камон, ясно же, как день, что в Татарстане просто полностью высосали из пальца официальную статистику смертей от ковида. О чем тут вообще можно спорить. Я же не говорю, что *все* избыточные смерти везде -- это результат недоучета ковидных смертей. Ваша гипотеза 1 тоже дает какой-то ненулевой вклад. Но в Татарстане и Башкортостане это просто смешно обсуждать, на мой взгляд.

[oude-rus.livejournal.com]

Эта дискуссия сильно напоминает дискуссии о статистических странностях голосования в Москве в 2011.
Я, кстати, подписался на комменты (и запасся орешками).

[kobak.livejournal.com]

Ну давай я тебя тогда порадую вот такой табличкой, которую я зачем-то вчера полночи делал.

(https://ic.pics.livejournal.com/kobak/1474765/27419/27419_original.png)

(Пояснение. Росстат раз в месяц публикует кол-во ковидных смертей по четырем категориям:
1) COVID-19, вирус идентифицирован
2) возможно, COVID-19, вирус не идентифицирован
3) COVID-19 не является основной причиной смерти, но оказал существенное влияние на развитие смертельных осложнений заболевания
4) COVID-19 не является основной причиной смерти и не оказал существенного влияния на развитие смертельных осложнений заболевания
Кол-во ковидных смертей, о которых пишут в прессе и которые попадают в международную статистику, -- это ежедневно обновляемые данные "оперативного штаба". Это кол-во еще меньше, чем первая категория Росстата, но ненамного.)

[nikolamsu.livejournal.com]

Я хочу еще раз подчеркнуть:
меня напрягает "методологическая" сторона вопроса.
Меня постоянно грызет мысль:
"А правильно ли мы реагируем на COVID"?
И пока не могу для себя найти ответа (тут мне как раз накидали ссылок, буду читать). Даже по вопросу "Так сколько же именно убивает болезнь, а сколько -- борьба с ней" ясности нет.
Я высоко ценю ваши работы по "стат. обработке" выборов в РФ в том числе и за то, что они позволяют пусть грубо, но все же оценить "реальные" результаты голосований.
В данном же случае я не понимаю, как можно увидеть "реальные" результаты (а эти результаты увидеть намного важней).

Так что по относительно маловажному вопросу у нас и спора как такового нет.
Вы не говорите, что *все* избыточные смерти везде -- это результат недоучета ковидных смертей.
Я не говорю, что *все* избыточные смерти везде -- это только борьба с болезнью, но никак не сама болезнь.
Но какие где вклады, хотя бы примерно??? В Москве недоучет дает, скажем, 20 процентов избыточных смертей, а в Казани -- 80??? И делать то что? :-)
********

Но и мелкий вопросик, который меня не столько беспокоит, сколько веселит.
Я заметил, что и у меня, и у многих разумных людей при попытках объяснения происходящих вокруг явлений "бюрократия", если появляется, то появляется в качестве "демонов" из знаменитого диалога с Фаустом о силе трения у Эрика Роджерса. Это там, где:
"ВЫ. Но когда я толкну кирпич достаточно сильно и кирпич начнет двигаться, то трение будет в дальнейшем тормозить его движение.
ФАУСТ. Ослабев, демоны попадают под кирпич, и их раздробленные кости мешают кирпичу скользить по поверхности стола..."
Этот подход мне тоже кажется неверным ... методологически :-)

[kobak.livejournal.com]

Я не говорю, что "все" избыточные смерти -- это ковидные смерти, но я утверждаю, что *почти все*.

Смотрите, я вот сейчас специально проверил: карантин в Башкирии (как и в других регионах) ввели в самом конце марта https://meduza.io/feature/2020/03/30/v-kakih-regionah-rossii-vveden-rezhim-samoizolyatsii-spisok. Никаких избыточных смертей там не было ни в апреле, ни в мае, ни в июне. Вообще никаких, ноль. Может, там какие-то единицы людей и умерли от карантина, но на общую статистику это не повлияло вообще. Делаем вывод: за три месяца карантин не приводит к заметному кол-ву избыточных смертей.

В июле туда пришла эпидемия (она распространяется по стране постепенно, начиная от Москвы, это хорошо видно по динамике регионов, я уже даже анимацию изготовил) и избыточная смертность составила 3000 человек. Вы говорите, что какая-то часть этого кол-ва может быть отложенными последствиями введения карантина четыре месяца назад. Но посмотрите, например, на Москву: в июле там избыточных смертей уже почти не было, из чего мы можем сделать второй вывод: никакого заметного кол-ва отложенных смертей через четыре месяца карантин не вызывает.

Единственное объяснение всему этому находится на поверхности: практически все из 3000 смертей -- это ковидные смерти.

Ответ на Ваш вопрос "Так сколько же именно убивает болезнь, а сколько -- борьба с ней" состоит в том, что "борьба" убивает статистически незначительное кол-во людей.

[in-kant.livejournal.com]

Единственный известный мне пример, который мог бы статистически подтвердить тезис "карантин сам по себе убивает" - это Австралия. Это страна, которая до начала июля была минимально затронута коронавирусом, но в которой при этом был максимально строгий карантин.
Избыточная смертность у них (с начала февраля по конец июня) по сравнению со средним за пять лет составила 1147 человек. Это меньше 2% от нормальной смертности. Но в то же время официальных ковидных смертей у них было всего 104 человека, причем они тестировали широко и тщательно, вряд ли пропустили многих. Я думаю, что случай Австралии - это хорошая верхняя оценка смертоносности карантина (хотя не надо забывать и повышение смертности из-за пожаров).

Жесткий карантин убил никак не больше 1000 человек на 25-миллионную страну. А как умеет убивать коронавирус, можно увидеть на многих печальных примерах.
Думаю, на гипотетическом графике "польза карантина в спасении жизней в зависимости от строгости карантина" наверняка есть максимум. Но где он - никто точно не скажет...

[sadretdinov alexandr (from livejournal.com)]

Да, наши жгут конечно. Прям лидеры рисования статистики. Обновите пожалуйста пост в конце года, за осень здесь будут весьма впечатляющие цифры...

Неизменный процент по Мск и СПб.

[jenia-levin.livejournal.com]

Кажется странным, что показанный на карте процент избыточной смертности в Москве и Санкт-Петербурге остаётся одинаковым и для июньских и для июльских и для августовских данных (57% и 45% соответственно). Может быть в скрипте какая-то ошибка?

Re: Неизменный процент по Мск и СПб.

[kobak.livejournal.com]

Это *максимальный* процент (за все месяцы), см. вторую строчку курсивом сверху наверху.

RE: Re: Неизменный процент по Мск и СПб.

[jenia-levin.livejournal.com]

Понятно, спасибо.