IFR омикрона
Jun. 29th, 2022 03:29 pmЯ понимаю, что сейчас всем (и мне тоже) не до ковида, но уже давно хочу кратко написать о летальности омикрона. Мы это обсуждали несколько раз еще до начала войны с
avva и
in_kant; Авва тогда писал, что "Как ни крути, омикрон очень легкая болезнь. Даже у иммунонаивных. Даже у пожилых. Конечно, пожилых с серьезнымни болезнями может убить и омикрон тоже, как их может убить и грипп, и банальная простуда". С тех пор прошло время и появились разные новые данные. Давайте посмотрим.
Подробное сравнениеIFR CFR омикрона и дельты по английским данным вышло недавно в Lancet: Comparative analysis of the risks of hospitalisation and death associated with SARS-CoV-2 omicron (B.1.1.529) and delta (B.1.617.2) variants in England: a cohort study, https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(22)00462-7. Они оценивают риск смерти от омикрона для имуннонаивных (т.е. не вакцинированных и не переболевших) как примерно 0.2 от риска для дельты, т.е. в 5 раз меньше. Для пожилых (80+) разница даже меньше, и ближе к 0.4. Но пусть в 5 раз меньше. Понятно, что омикрон действительно гораздо легче дельты. Картинка из статьи:

Но не будем забывать, что сама дельта сильно опаснее первоначального варианта. Вот статья по канадским данным: Evaluation of the relative virulence of novel SARS-CoV-2 variants: a retrospective cohort study in Ontario, Canada, https://www.cmaj.ca/content/193/42/E1619. Они оцениваютIFR CFR дельты в 2.3 раза выше, чем у исходного варианта.

Получается, что омикрон где-то в 2 раза легче исходного варианта. Для сравнения, IFR исходного варианта где-то в ~25 раз выше сезонного гриппа: https://github.com/mbevand/covid19-age-stratified-ifr, т.е. омикрона где-то в ~10 раз выше. Мне кажется, это нельзя назвать "очень легкой болезнью".
Кроме того, интересно посмотреть на избыточную смертность в не очень хорошо вакцинированных странах, где волна омикрона -- это фактически первая волна ковида. Это, например, Южная Корея и Гонконг. Там весной 2022 года всплеск смертности не меньше, чем в Италии или Англии в весной 2020: https://github.com/dkobak/excess-mortality.

График избыточной смертности в Гонконге, мне кажется, закрывает тему с "очень легкой болезнью" и явно показывает, что это не так (на всякий случай: речь об иммунонаивных!).
Update: https://avva.livejournal.com/3454182.html
Update 2: Я выше неаккуратно написал, в этих статьях оценивается не разница в IFR, а разница в CFR, конечно. Т.е. если предположить, что с омикроном больше заражений, чем с дельтой, проходят вообще без симптомов, то разница в CFR в пять раз может соответствовать более высокой разнице в IFR...
Подробное сравнение

Но не будем забывать, что сама дельта сильно опаснее первоначального варианта. Вот статья по канадским данным: Evaluation of the relative virulence of novel SARS-CoV-2 variants: a retrospective cohort study in Ontario, Canada, https://www.cmaj.ca/content/193/42/E1619. Они оценивают

Получается, что омикрон где-то в 2 раза легче исходного варианта. Для сравнения, IFR исходного варианта где-то в ~25 раз выше сезонного гриппа: https://github.com/mbevand/covid19-age-stratified-ifr, т.е. омикрона где-то в ~10 раз выше. Мне кажется, это нельзя назвать "очень легкой болезнью".
Кроме того, интересно посмотреть на избыточную смертность в не очень хорошо вакцинированных странах, где волна омикрона -- это фактически первая волна ковида. Это, например, Южная Корея и Гонконг. Там весной 2022 года всплеск смертности не меньше, чем в Италии или Англии в весной 2020: https://github.com/dkobak/excess-mortality.

График избыточной смертности в Гонконге, мне кажется, закрывает тему с "очень легкой болезнью" и явно показывает, что это не так (на всякий случай: речь об иммунонаивных!).
Update: https://avva.livejournal.com/3454182.html
Update 2: Я выше неаккуратно написал, в этих статьях оценивается не разница в IFR, а разница в CFR, конечно. Т.е. если предположить, что с омикроном больше заражений, чем с дельтой, проходят вообще без симптомов, то разница в CFR в пять раз может соответствовать более высокой разнице в IFR...