избыточная смертность по странам
Dec. 28th, 2020 12:37 am![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
kobakНастроил скрипт, который загружает последние данные по общей смертности с https://www.mortality.org, FT (https://github.com/Financial-Times/coronavirus-excess-mortality-data), NYT (https://github.com/nytimes/covid-19-data) и The Economist (https://github.com/TheEconomist/covid-19-excess-deaths-tracker). Для каждой страны я считаю избыточную смертность по отношению к прогнозу с учетом линейнего тренда 2015--19. Начало отсчета избыточной смертности -- дата первой официальной ковидной смерти. В данных с www.mortality.org я для некоторых стан отбрасываю последние две недели, т.к. там явно неполные данные.
Для каждой страны я считаю: избыточную смертность (левый нижний угол), избыточную смертность в % от ожидаемого за весь год (правый нижний угол), избыточную смертность на 100 тысяч населения (правый верхний угол) и отношение избыточной смертности к оперативным ежедневно обновляемым данным за тот же период (левый верхний угол).
Вертикальная шкала везде начинается от нуля, но заканчивается как получится, чтобы все линии поместились. Иначе всего не разглядеть.
Страны отсортированы по избыточной смертности в % от годовой.
В России на данный момент оперштаб сообщает о 54.7 тыс. умерших, с учетом коэффициента 6.5 -- это где-то 350 тыс. избыточной смертности. Так что по избыточной смертности *на сегодня* РФ на втором месте после США, по % от годовой после Перу, Боливии, Эквадора и Мексики (близко от Мексики уже), по избыточной смертности на 100 тысяч населения приближается к Перу, по отношению реальности к оперативным данным явно вне конкуренции.
UPDATE (Dec 29): Добавил ноябрь к России.
UPDATE (Dec 30): Добавил Украину, спасибо Ивану Зайцеву. Выложил код на на https://github.com/dkobak/excess-mortality. Все данные подгружаются из облака, так что можно прямо в браузере запустить: https://colab.research.google.com/github/dkobak/excess-mortality/blob/main/all-countries.ipynb
UPDATE (Jan 4): Добавил Иран.
UPDATE (Jan 8): Добавил Грузию и Армению, спасибо![[livejournal.com profile]](https://www.dreamwidth.org/img/external/lj-userinfo.gif)
athanatoi. Для США беру теперь данные с CDC, где последние недели скорректированы с учетом неполного покрытия.
Для каждой страны я считаю: избыточную смертность (левый нижний угол), избыточную смертность в % от ожидаемого за весь год (правый нижний угол), избыточную смертность на 100 тысяч населения (правый верхний угол) и отношение избыточной смертности к оперативным ежедневно обновляемым данным за тот же период (левый верхний угол).
Вертикальная шкала везде начинается от нуля, но заканчивается как получится, чтобы все линии поместились. Иначе всего не разглядеть.
Страны отсортированы по избыточной смертности в % от годовой.
В России на данный момент оперштаб сообщает о 54.7 тыс. умерших, с учетом коэффициента 6.5 -- это где-то 350 тыс. избыточной смертности. Так что по избыточной смертности *на сегодня* РФ на втором месте после США, по % от годовой после Перу, Боливии, Эквадора и Мексики (близко от Мексики уже), по избыточной смертности на 100 тысяч населения приближается к Перу, по отношению реальности к оперативным данным явно вне конкуренции.
UPDATE (Dec 29): Добавил ноябрь к России.
UPDATE (Dec 30): Добавил Украину, спасибо Ивану Зайцеву. Выложил код на на https://github.com/dkobak/excess-mortality. Все данные подгружаются из облака, так что можно прямо в браузере запустить: https://colab.research.google.com/github/dkobak/excess-mortality/blob/main/all-countries.ipynb
UPDATE (Jan 4): Добавил Иран.
UPDATE (Jan 8): Добавил Грузию и Армению, спасибо
athanatoi. Для США беру теперь данные с CDC, где последние недели скорректированы с учетом неполного покрытия.
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2020-12-30 11:07 pm (UTC)Думаю, что тут свертка двух факторов: альпийские горнолыжные курорты и действия властей + национальные особенности. Все-таки страны действовали по-разному, и у них была разная фора в самом начале (тогда разница в две-три недели давала качественно иной итоговый результат). Но главное - итальянские Альпы. Про это мало говорят, но основным источником мировой пандемии (это можно отслеживать по мутациям вируса) стал вовсе не Китай, а Италия с ее лыжными курортами. А кто ездит кататься на лыжах в Альпы? Да кто побогаче просто, и у кого своих гор нет.
Всякие поляки, чехи и прочие венгры или бедные, или в Татры и прочие Карпаты ездили. А западные европейцы наоборот, в феврале весело тусили на альпийских курортах, а потом повезли вирус к себе домой.
Такое вот мое ИМХО.
А Эстонский кейс интересен не тем, что там пандемия почти не разгулялась (таких стран несколько), а вот этими примерами. Кажется, что там очевидно выходит гораздо бОльший процент бессимптомных носителей (и вероятно радикально более низкий IFR), чем в других местах.
no subject
Date: 2020-12-30 11:19 pm (UTC)no subject
Date: 2020-12-31 05:46 pm (UTC)У Испании тоже "альпийские горнолыжные курорты"? как-то сомнительно. Или, например, в Нидерланды вирус занесли из Австрии -- но сами австрияки выкрутились почти без потерь. Или Германия, тоже на курортах паслась и -- ничего.
Ну и наконец откуда взялся вирус в Альпах?
А разницу в две-три недели просрали ничуть не хуже полимеров.